DNA含量测定全流程解析:提取纯化到仪器检测的注意事项
你有没有想过,为什么实验室小白第一次做DNA检测总像开盲盒?明明跟着教程操作,最后要么浓度测不准,要么电泳条带糊成一片?今天咱们用厨房做菜的逻辑,把DNA含量测定的全流程拆解成「买菜→洗菜→炒菜→试吃」四步走,手把手带你避开那些教科书不写的坑!
一、菜市场挑菜:样本处理要讲究
??1. 样本采集的玄学??
血样、组织块、唾液...不同材料处理起来差别大了去了!比如取植物叶片??千万别选老叶子??,纤维素太多会堵住提取管;采血液样本得用抗凝管,否则红细胞裂解液一加,分分钟变成血豆腐块。
??新手必看三原则??:
① ??低温保命??:采完样立马放冰盒,DNA酶这玩意儿专搞破坏;
② ??别贪多??:0.5g动物肝脏就够用,多出来的只会增加杂质;
③ ??预处理要快??:像植物材料泡完酒精还得晾干,否则残留水分会让裂解液变"洗洁精"。
二、洗菜环节:提取方法大比拼
??方法选择红黑榜??
方法 | 优点 | 缺点 | 适合人群 |
---|---|---|---|
酚氯仿法 | ??便宜(10元/次)?? | 操作繁琐易污染 | 预算有限实验室 |
磁珠法 | ??全程20分钟搞定?? | 磁珠容易吸附不彻底 | 急诊检测 |
试剂盒法 | ??傻瓜式操作?? | 价格是前两种的5倍 | 新手小白首选 |
举个栗子:实验室小王用酚氯仿法提小鼠肝脏DNA,结果电泳出现拖尾带——原来他在??裂解时忘记加蛋白酶K??,导致蛋白质没消化干净。现在改用试剂盒,虽然心疼钱,但至少数据能见人。
三、炒菜火候:纯化环节生死线
??三大翻车现场??:
- ??乙醇沉淀总失败??:记住"七成饱"原则!加无水乙醇到液体变浑浊就停手,别等到全混浊——过量会导致盐分沉淀;
- ??离心转速是玄学??:12000rpm和10000rpm差别有多大?告诉你个秘密:前者能甩出更紧实的DNA沉淀,但超过15分钟会把沉淀压得太实,反而难溶解;
- ??晾干时间看天气??:南方梅雨季建议用真空干燥仪,北方干燥地区室温晾10分钟就行,否则DNA会脆成渣渣。
??自检小技巧??:拿20μl TE缓冲液溶解沉淀时,如果出现絮状物——别慌!可能是蛋白质残留,赶紧用氯仿再抽提一次。
四、试吃环节:仪器检测的猫腻
??分光光度计使用三宗罪??:
① ??A260测不准??:新手常犯的错是没调零!先用空白液校准,再测样本;
② ??纯度比值迷思??:A260/A280=1.6就完蛋?未必!植物DNA普遍偏低,1.5也能用;
③ ??浓度虚高陷阱??:RNA残留会让数值虚高,这时候得加RNA酶处理后再测。
??电泳避坑指南??:
- 胶浓度选1%还是0.8%?记住口诀:"大片段选低胶,小片段用高胶"
- 条带出现笑脸状?那是胶没凝固就通电,边缘跑得快中间慢
- Marker不显影?可能是EB过期了,赶紧换新的染色剂
五、个人血泪经验谈
在实验室摸爬滚打三年,总结出三条铁律:
- ??别迷信高级设备??:300块的分光光度计和3万块的超微量仪器,测浓度误差不超过5%;
- ??耗材才是亲爹??:买正品离心管比选方法更重要,劣质管子会吸附DNA;
- ??记录要像写日记??:特别是乙醇沉淀的时间,差5分钟都可能影响得率。
最后说句大实话:DNA检测就像煮泡面,流程看似简单,但水温差一度、时间差一秒都会影响口感。掌握基本原理后,多动手比看一百篇文献都管用!
本文由嘻道妙招独家原创,未经允许,严禁转载